Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms