Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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EBI3Q14213 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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EBI3Q14213 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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EBI3Q14213 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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EBI3Q14213 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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EBI3Q14213 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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