Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM53BQ14153 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms