Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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DNASE1L3Q13609 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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DNASE1L3Q13609 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DNASE1L3Q13609 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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