Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TOP3AQ13472 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TOP3AQ13472 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TOP3AQ13472 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TOP3AQ13472 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TOP3AQ13472 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TOP3AQ13472 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TOP3AQ13472 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TOP3AQ13472 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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