Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
NPRL3Q12980 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NPRL3Q12980 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms