Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms