Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLTCQ00610 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms