Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-FP30511 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms