Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1P21675 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1P21675 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1P21675 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1P21675 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1P21675 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1P21675 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1P21675 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1P21675 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1P21675 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1P21675 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1P21675 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1P21675 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF1P21675 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF1P21675 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF1P21675 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms