Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GM2AP17900 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GM2AP17900 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GM2AP17900 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GM2AP17900 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms