Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GP1BBP13224 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GP1BBP13224 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms