Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMIM10L1P0DMW3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM10L1P0DMW3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms