Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LRRTM2O43300 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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