Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHANK2Q9UPX8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms