Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms