Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS51Q9UID3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS51Q9UID3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms