Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD42

CHMP1A, Charged multivesicular body protein 1a, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1AQ9HD42 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHMP1AQ9HD42 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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