Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nsmce3Q9CPR8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms