Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
RETNLBQ9BQ08 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms