Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBL7Q96S82 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms