Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFAP53Q96M91 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP53Q96M91 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms