Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF548Q8NEK5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF548Q8NEK5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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