Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM20Q6UY09 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms