Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HRCT1Q6UXD1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms