Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC27A3Q5K4L6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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