Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
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SHROOM2Q13796 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
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SHROOM2Q13796 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHROOM2Q13796 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
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