Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
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GRIN2AQ12879 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GRIN2AQ12879 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
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