Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC15Q0P6D6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms