Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PSG5-207ENST00000407568 1064 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms