Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSG1Q02413 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms