Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SUCLG1P53597 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms