Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCC3P46736 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms