Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRMP28827 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRMP28827 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
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