Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGA10O75578 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA10O75578 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms