Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SKAP2O75563 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms