Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf47A7E2U8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms