Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K4Q9Y6R4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms