Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM2AQ9Y2K7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms