Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMG20BQ9P0W2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms