Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDAP2Q9NXN4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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