Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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