Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF354BQ96LW1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF354BQ96LW1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF354BQ96LW1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF354BQ96LW1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms