Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOLD1Q96LR9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms