Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms