Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SKAP1Q86WV1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms