Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STRCQ7RTU9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms