Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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LAMA3Q16787 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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LAMA3Q16787 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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LAMA3Q16787 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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LAMA3Q16787 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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LAMA3Q16787 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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LAMA3Q16787 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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LAMA3Q16787 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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LAMA3Q16787 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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