Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCM1Q15154 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms