Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC3Q15034 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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